Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA1P52294 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms