Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR1P43307 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR1P43307 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR1P43307 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR1P43307 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR1P43307 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR1P43307 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR1P43307 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR1P43307 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR1P43307 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR1P43307 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR1P43307 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR1P43307 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR1P43307 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR1P43307 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR1P43307 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR1P43307 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR1P43307 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR1P43307 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms