Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms