Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms