Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN1P18031 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms