Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDN1P05305 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDN1P05305 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDN1P05305 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDN1P05305 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDN1P05305 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDN1P05305 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDN1P05305 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDN1P05305 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDN1P05305 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDN1P05305 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDN1P05305 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDN1P05305 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDN1P05305 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDN1P05305 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDN1P05305 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDN1P05305 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDN1P05305 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDN1P05305 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDN1P05305 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDN1P05305 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDN1P05305 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms