Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP3O75386 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP3O75386 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP3O75386 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP3O75386 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP3O75386 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP3O75386 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP3O75386 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP3O75386 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP3O75386 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP3O75386 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TULP3O75386 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP3O75386 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms