Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB2O43741 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB2O43741 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms