Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BM21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BM21 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BM21 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BM21 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BM21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BM21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BM21 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BM21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BM21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BM21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms