Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YVX5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms