Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL121892.1-201ENST00000422574 833 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC011294.1-201ENST00000487094 844 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CCDC89-201ENST00000316398 1412 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC005154.1-217ENST00000584199 581 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SSPN-207ENST00000540266 587 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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