Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms