Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms