Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PRR19-202ENST00000499536 1956 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZNF213-AS1-204ENST00000572691 3232 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ARMC8-201ENST00000358441 3181 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HCG2040054-202ENST00000439182 362 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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