Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TSPYL6-201ENST00000317802 3089 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F35P-201ENST00000582957 2876 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BCO1-201ENST00000258168 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL6-204ENST00000379244 2658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL390728.2-201ENST00000400933 1670 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf94-201ENST00000373374 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EMP1-202ENST00000396301 675 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2B-AS1-203ENST00000428597 3835 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms