Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1P21675 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1P21675 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1P21675 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF1P21675 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms