Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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