Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPL23P62829 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms