Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC3P51654 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC3P51654 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC3P51654 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms