Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PF4P02776 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PF4P02776 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PF4P02776 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PF4P02776 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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