Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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