Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX6O43752 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
STX6O43752 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX6O43752 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX6O43752 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX6O43752 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms