Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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