| PTPRJ | Q12913 | NUBP1-202 | ENST00000433392 | 1185 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC012362.1-201 | ENST00000434906 | 739 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL356056.1-201 | ENST00000437899 | 369 nt | TSL 5 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GNG10P1-201 | ENST00000452289 | 199 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC019118.1-201 | ENST00000454530 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC011383.1-201 | ENST00000517474 | 617 nt | TSL 3 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARL17B-203 | ENST00000570618 | 1140 nt | TSL 2 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRMT112P3-201 | ENST00000580149 | 358 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MBP-238 | ENST00000580402 | 915 nt | TSL 5 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL136982.5-201 | ENST00000605222 | 294 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARL16-214 | ENST00000621051 | 1181 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNF145-202 | ENST00000424310 | 3613 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SDR16C5-202 | ENST00000396721 | 2399 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NDFIP2-201 | ENST00000218652 | 4625 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PBXIP1-203 | ENST00000368465 | 3144 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM13B-203 | ENST00000425075 | 3098 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AFDN-203 | ENST00000366806 | 5962 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DCAF8-201 | ENST00000326837 | 3972 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | USP19-205 | ENST00000398898 | 4474 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FARS2-201 | ENST00000274680 | 1663 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.05 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HMOX2-201 | ENST00000219700 | 1621 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STAMBP-204 | ENST00000409707 | 1649 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NFATC4-206 | ENST00000539237 | 5686 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHB14-201 | ENST00000239449 | 4828 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NUB1-201 | ENST00000413040 | 3180 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPLP1-201 | ENST00000421896 | 1501 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC021305.1-201 | ENST00000520656 | 1514 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GBAP1-208 | ENST00000566701 | 1546 nt | BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ASB3-204 | ENST00000406687 | 2205 nt | TSL 2 BASIC | 14.71 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EXT1-201 | ENST00000378204 | 8270 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHB3-201 | ENST00000231130 | 3355 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZDHHC11-201 | ENST00000283441 | 2604 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | APBB1-201 | ENST00000299402 | 2636 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UBTF-209 | ENST00000529383 | 2570 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CST1-201 | ENST00000304749 | 760 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MBD3L3-201 | ENST00000333843 | 775 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MDS2-201 | ENST00000374555 | 1029 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PIK3IP1-202 | ENST00000402249 | 999 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NDUFS7-203 | ENST00000414651 | 841 nt | TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC016730.1-201 | ENST00000420828 | 832 nt | TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC004895.1-202 | ENST00000435547 | 547 nt | TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAHD2CP-203 | ENST00000467292 | 965 nt | TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SOX2-OT-209 | ENST00000485035 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC013553.1-201 | ENST00000560906 | 267 nt | BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SOX2-OT-222 | ENST00000595084 | 853 nt | TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SOX2-OT-232 | ENST00000600386 | 792 nt | TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP000356.3-203 | ENST00000614808 | 601 nt | TSL 3 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Metazoa_SRP.144-201 | ENST00000617007 | 311 nt | BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CCL3L3-203 | ENST00000619989 | 784 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNX1-214 | ENST00000625244 | 324 nt | TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CTCFL-205 | ENST00000423479 | 2478 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARHGAP45-201 | ENST00000313093 | 4273 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LONP1-202 | ENST00000540670 | 3002 nt | TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GPRASP1-205 | ENST00000537097 | 5980 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF202-207 | ENST00000530393 | 3564 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LAS1L-202 | ENST00000374807 | 2386 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | E2F3-201 | ENST00000346618 | 4749 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRPV6-201 | ENST00000359396 | 2928 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OPA1-203 | ENST00000361715 | 6384 nt | TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MOCS3-201 | ENST00000244051 | 5106 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RIMS1-216 | ENST00000521978 | 5079 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MXD1-206 | ENST00000540449 | 5580 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGHG3-202 | ENST00000641136 | 2751 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC6A20-202 | ENST00000358525 | 5423 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PDPK1-201 | ENST00000268673 | 4728 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CREB3L4-204 | ENST00000368603 | 1557 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRMT2B-206 | ENST00000545398 | 3106 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRAF3IP3-204 | ENST00000367026 | 2058 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DRD3-201 | ENST00000295881 | 1541 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MBOAT4-201 | ENST00000320542 | 1512 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | COPS7B-223 | ENST00000611614 | 2468 nt | TSL 3 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | APBB3-205 | ENST00000412920 | 1455 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CT55-201 | ENST00000276241 | 1445 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | POM121L4P-202 | ENST00000427789 | 1891 nt | BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL356258.1-201 | ENST00000605929 | 2246 nt | TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAP7D2-201 | ENST00000379643 | 3918 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IL23A-201 | ENST00000228534 | 1046 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR0B2-201 | ENST00000254227 | 1156 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VPS29-201 | ENST00000360579 | 1091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IFNLR1-203 | ENST00000374418 | 674 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CUTA-203 | ENST00000374500 | 937 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGHV3-49-201 | ENST00000390625 | 439 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNU13-204 | ENST00000402458 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRAMD1A-203 | ENST00000424536 | 808 nt | TSL 2 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CTCFL-208 | ENST00000432255 | 2955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL359979.2-201 | ENST00000435108 | 613 nt | TSL 3 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL365500.1-201 | ENST00000442783 | 868 nt | TSL 3 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZAP70-202 | ENST00000451498 | 1085 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC108199.1-201 | ENST00000504249 | 508 nt | TSL 3 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NKX3-1-202 | ENST00000523261 | 713 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMEM106A-201 | ENST00000536052 | 1181 nt | TSL 2 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RAP1B-216 | ENST00000537460 | 1072 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C14orf132-201 | ENST00000553764 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MT2A-202 | ENST00000561491 | 581 nt | TSL 2 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PPCDC-206 | ENST00000564923 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC145207.8-201 | ENST00000580897 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NAT9-224 | ENST00000583757 | 583 nt | TSL 3 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TUBB6-214 | ENST00000592683 | 481 nt | TSL 4 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GMFG-209 | ENST00000600322 | 622 nt | TSL 5 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | U62317.3-201 | ENST00000608319 | 855 nt | BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |