Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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SYT1P21579 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SYT1P21579 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYT1P21579 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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