Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINC1P01008 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms