Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms