Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK3Q9Y2K2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms