Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms