Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJD2Q9UKL4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJD2Q9UKL4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD2Q9UKL4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms