Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EHD3Q9NZN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EHD3Q9NZN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms