Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC31BQ9NQW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms