Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A4GALTQ9NPC4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A4GALTQ9NPC4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms