Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF39Q9H2S5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF39Q9H2S5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms