Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC68Q9H2F9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC68Q9H2F9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms