Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC46A2Q9BY10 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms