Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDF4Q9BRK5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms