Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHDQ96IW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms