Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIFAQ96CG3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIFAQ96CG3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms