Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 GALNT7-204ENST00000505308 1658 ntTSL 27.76□□□□□ -1.175e-9■■■■■ 46.2
PUM2Q8TB72 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 CENPC-203ENST00000506882 3436 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.842e-52■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 CENPC-206ENST00000513216 2799 ntTSL 53.73□□□□□ -1.812e-52■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.239e-8■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 PPHLN1-226ENST00000624028 5975 nt7.24□□□□□ -1.259e-8■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.379e-8■■■■■ 46.1
PUM2Q8TB72 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 46
PUM2Q8TB72 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-12■■■■■ 45.9
PUM2Q8TB72 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-12■■■■■ 45.9
PUM2Q8TB72 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 27.94□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 45.9
PUM2Q8TB72 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-12■■■■■ 45.9
PUM2Q8TB72 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 DNAJB5-209ENST00000541010 5228 ntTSL 312.42□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.123e-13■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.323e-13■■■■■ 45.8
PUM2Q8TB72 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 414.24□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 26.15□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 56.08□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 45.7
PUM2Q8TB72 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 45.6
PUM2Q8TB72 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 45.6
PUM2Q8TB72 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.385e-13■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-13■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.025e-13■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-13■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 AC233992.1-201ENST00000525023 444 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.765e-13■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 DGAT1-208ENST00000620428 444 ntTSL 210.32□□□□□ -0.765e-13■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.097e-15■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 RBM5-212ENST00000464087 5616 ntTSL 27.92□□□□□ -1.147e-15■■■■■ 45.5
PUM2Q8TB72 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 45.4
PUM2Q8TB72 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 45.4
PUM2Q8TB72 MXD1-205ENST00000465446 490 ntTSL 27.2□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 45.4
PUM2Q8TB72 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.125e-27■■■■■ 45.4
PUM2Q8TB72 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 45.4
PUM2Q8TB72 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.386e-10■■■■■ 45.4
PUM2Q8TB72 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-15■■■■■ 45.3
PUM2Q8TB72 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.153e-11■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.623e-11■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-223ENST00000638369 4205 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-202ENST00000400334 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-246ENST00000640268 3804 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-201ENST00000357637 4723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-235ENST00000639491 2971 ntTSL 58.4□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-237ENST00000639681 4349 ntTSL 58.09□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-209ENST00000587942 2177 ntTSL 27.81□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-248ENST00000640593 3184 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 45.2
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PUM2Q8TB72 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-249ENST00000640682 2412 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-236ENST00000639600 2493 ntTSL 55.42□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-234ENST00000639372 5431 ntTSL 55.08□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-243ENST00000640170 4505 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-227ENST00000638858 4112 ntTSL 54.98□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-13■■■■■ 45.2
PUM2Q8TB72 NUP98-220ENST00000533346 580 ntTSL 29.14□□□□□ -0.951e-11■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 RPL35A-208ENST00000485439 677 ntTSL 27.09□□□□□ -1.271e-323■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 RPL35A-201ENST00000329092 456 ntTSL 34.96□□□□□ -1.621e-323■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 34.71□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.468e-8■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.738e-8■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.472e-21■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-21■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-72■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 PCIF1-202ENST00000479348 1324 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.312e-72■■■■■ 45.1
PUM2Q8TB72 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.991e-323■■■■■ 45
PUM2Q8TB72 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-323■■■■■ 45
PUM2Q8TB72 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 217.69■□□□□ 0.421e-323■■■■■ 45
PUM2Q8TB72 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-323■■■■■ 45
PUM2Q8TB72 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 26.29□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 45
PUM2Q8TB72 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.166e-23■■■■■ 44.9
PUM2Q8TB72 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 210.04□□□□□ -0.86e-23■■■■■ 44.9
PUM2Q8TB72 MARCH6-214ENST00000606497 1334 ntTSL 48.3□□□□□ -1.088e-19■■■■■ 44.9
PUM2Q8TB72 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-12■■■■■ 44.9
PUM2Q8TB72 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-12■■■■■ 44.9
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