Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP4

MDGA1, MAM domain-containing glycosylphosphatidylinositol anchor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDGA1Q8NFP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDGA1Q8NFP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDGA1Q8NFP4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms