Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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