Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN4Q8IWV2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms