Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF5Q86SE9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF5Q86SE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms