Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE2Q6PIF2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms