Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X7

TMEM71, Transmembrane protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM71Q6P5X7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM71Q6P5X7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM71Q6P5X7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms