Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PXDC1Q5TGL8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms