Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATAD3CQ5T2N8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATAD3CQ5T2N8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms