Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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KRTAP21-3Q3LHN1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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KRTAP21-3Q3LHN1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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