Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM183BQ1AE95 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM183BQ1AE95 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms